АНАЛИЗ АССОЦИАЦИЙ ПОЛИМОРФНЫХ ВАРИАНТОВ ГЕНОВ Т1МР-2 ПРИ ЯЗВЕННОЙ БОЛЕЗНИ ЖЕЛУДКА

ВВЕДЕНИЕ 3 ГЛАВА 1. 5 1.1. Язвенная болезнь желудка – этиология и патогенез 5 1.2. Генетические маркеры язвенной болезни 13 1.3. Роль некоторых бактерий в развитии язвы желудка 22 ЗАКЛЮЧЕНИЕ 27 СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ И ЛИТЕРАТУРЫ 28 СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ 36

1. Абатуров А.Е.. Хеликобактерная инфекция у детей: особенности диагностики и лечения / А.Е Абатуров, О.Н. Герасиминко // На подмогу педиатру. - 2011. - №4 (31). - С. 93 - 97. 2. Аруин Л.И. Морфологическая диагностика болезней желудка и кишечника / Л. И. Аруин, Л.Л. Капуллер, В.А. Исаков // М.: Триада-Х. 1998. 3. Барановский А.Ю. Гастроэнтерология: Справочник/ А. Ю. Барановский // Под ред. А.Ю. Барановского. — СПб.: Питер, 2011. — 512 с. 4. Бебурешвили А.Г. Язвенная болезнь желудка и двенадцатиперстной кишки/ А. Г. Бебурешвили, И. В. Михин, Е. Н. Зюбина // Методические рекомендации для врачей. Волгоград – 2007. – 72с. 5. Беликов В. В. О совокупности социальных факторов в возникновении, течении и профилактике язвенной болезни желудка и двенадцатиперстной кишки / В. В. Беликов, А. С. Артюхов // ДВГМУю -2000 - №1. - С. 34 – 36. 6. Васильев Ю. В. Язвенная болезнь и Helicobacter pylori (вопросы для дискуссии) / Ю. В. Васильев // Губернские медицинские вести. - 2002. -№2. - С. 8-9. 7. Горшенин Т.Л. Особенности течения язвенной болезни двенадцатиперстной кишки у людей пожилого и старческого возраста / Т.Л. Горшенин, Т.И. Оболенская, В.А. Сидоренко, А.А. Смирнов, К.И. Русакевич, В.В. Колосков //Фундаментальные исследования. - 2012. - №2. - С. 192 - 197. 8. Громова О.А. Магний и пиридоксин: основы знаний / О.А. Громова // М.: Изд-во. 2006. 9. Гришина Л. П. Особенности общего контингента инвалидов вследствие заболеваний органов пищеварения в Москве / Л. П. Гришина, Т. И. Анчеева // Проблемы управления здравоохранением. – 2002. – № 4. – С. 43–44. 10. Гурин Н.Н. Выбор метода лечения язв желудка / Н.Н. Гурин, К.В. Логунов // СПб.: СПбМАПО, Фолиант, 2001. – С. 35–49. 11. Жерлов Г.К. Современные тенденции диагностики и лечения гастродуоденальных язв / Г.К. Жерлов //Бюллетень сибирской медицины.№4. – 2003. С. 5 – 14. 12. Жернакова Н.И. Мелатонин и другие сигнальные молекулы в развитии соматической патологии у пожилых / Н.И. Жернакова, Д.С. Медведев, К.А. Иванова, А.В. Антропов //Научные ведомости. – 2010.- №22. – С. 75 -77. 13. Ивашкин В.Т. Рекомендации по диагностике и лечению язвенной болезни (пособие для врачей) / В.Т. Ивашкин, А.А. Шептулин, Е.К. Баранская, Т.Л. Лапина, Д.Р. Хакимова // М., 2005. C. 32. 14. Клишо Е.В. Роль матриксных металлопротеиназ в развитии и прогнозе плоскоклеточных карцином головы и шеи / Е.В. Клишо, И.В. Кондакова, Е.Л. Чойнзонов, Д.А. Шишкин, О.В. Черемисина, С.Ю. Чижевская // Сибирский онкологический журнал. – 2009. - №6. – С. 48 – 53. 15. Лисицина И.А. Значение полиморфизма гена интрелейкина-8 в развитии заболеваний желудка и двенадцатиперстной кишки, ассоциированных с Helicobacter pylori / И.А. Лисицина // Диссертация на соискание кандидата медицинских наук. – Москва. – 2010. – 143с. 16. Лобанков В.М. Особенности течения язвенной болезни у близнецов / В.М. Лобанков, М.Н. Камбалов, С.В. Иванов // Новости хирургии - 2008. -№2. - Т.16. - С. 35 - 38. 17. Маев И.В. Аллельный полиморфизм интерлейкина-1? при геликобактериозе / И.В. Маев, Ю.А. Кучерявый, Т.С. Оганесян // РЖГК – 2008. - №5. – С.4 – 11. 18. Минушкин О.Н. Диагностика Helicobacter pylori -инфекции у пациентов с язвенной болезнью двенадцатиперстной кишки / О.Н. Минушкин, Н.Ю. Васильева // Кремлевская медицина. Клин. Вестник.-1998.- №2. - с. 9-11. 19. Мишкина Т.В. Влияние различных генотипов Helicobacter pylori на клинико-эндоскопические и морфологические проявления хронических гастродуоденальных заболеваний у детей и подростков / Т.В. Мишкина, В.А. Александрова, А.Н. Суворов // Педиатрия. - 2007. - №5 (86). - С. 28 - 32. 20. Пустынкина Л.С. Медико-социальные аспекты инвалидности, экспертизы и реабилитация больных инвалидов с последствиями оперативного лечения язвенной болезни желудка и двенадцатиперстной кишки : автореф. дис. … канд. мед. наук / Л.С. Пустынкина // М., 2000. – 24 с. 21. Сарсенбаева А.С. Роль вирулентных штаммов Helicobacter pylori в формировании осложнений язвенной болезни двенадцатиперстной кишки / А.С. Сарсенбаева // Известия Челябинского научного центра. - 2005 - №2 (28). - С.121 - 124. 22. Сеитова Г.Н. Ассоциация полиморфных вариантов генов цитокинов (TNF и IL8) с развитием хронической обструктивной болезни легких / Г.Н. Сеитова, Е.Б. Букреева, И.С. Кремис, В.П. Пузырев // Бюллетень сибирской медицины – 2010. - №3. – С. 91 – 98. 23. Фадеев П.А. Язвенная болезнь / П.А. Фадеев // М.: ООО"Издательство ОНИКС".: ООО " Издательство "Мир и Образование"", 2009. - 128 с. 24. Шадрин О.Г. Язвенная болезнь в практике детского гастроэнтеролога / О.Г. Шадрин, С.И. Герасимюк // Сучасна Гатроентерология – 2009. - №4. – С.76 – 82. 25. Шкитин В.А. Роль Helicobacter pylori в патологии человека / В.А. Шкитин, А.И. Шпирна, Г.Н. Старовойтов // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2002. - №2 (4). - С. 128 - 145. 26. Ярилин А.А. Иммунология / А.А. Ярилин // М.: ГЭОТАР-Медия, 2010.- 749с. 27. Abdullah S.M. Infection with Helicobacter pylori strains carrying babA2 and cagA is associated with an increased risk of peptic ulcer disease development in Iraq / S.M. Abdullah, N.R. Hussein, A.M. Salih, M.A. Merza, A.A. Goreal, O.Y. Odeesh, H.S. Majed, M.A. Assafi, K. Hawrami // Arab J of Gastroenterology. – 2012. – V. 13. – P. 166 – 169. 28. Abramson, J.H. WINPEPI updated: computer programs for epidemiologists, and their teaching potential / J.H. Abramson // Epidemiol. Perspectives Innovations. – 2011. – V.8. – P.1–9. 29. Amieva M.R. Host-bacterial interactions in Helicobacter pylori infection / M.R. Amieva, E.M. El-Omar // Gastroenterology 2008;134(1):306-23 30. Auron P.E. Nucleotide sequence of human monocyte interleukin 1 precursor cDNA / P.E. Auron, A.C. Webb, L.J. Rosenwasser, S.F. Mucci, A. Rich, S.M. Wolff, C.A. Dinarello // Proc. Nat. Acad. Sci. - 1984. - V. 81. - P. 7907 -7911. 31. Azuma T. Pepsinogen C gene polymorphism associated with gastric body ulcer / T. Azuma, N. Teramae, T. Hayakumo, K. Yasuda, M. Nakajima, T. Kodama, H. Inokuchi, K. Hayashi, R.T. Taggart, K.Kawai // GUT. – 1993. – V. 4. – P. 450 – 455. 32. Baltrus D.A. The complete genome sequence of Helicobacter pylori strain G27 / D.A. Baltrus, M.R. Amieva, A. Covacci, T.M. Lowe, D.S. Merrell, K.M. Ottemann, M. Stein, N.R. Salama, K. Guillemin // Journal of bacteriology. – 2009. – V.191. – P. 447-448. 33. Bergin P.J. Increased production of matrix metalloproteinases in Helicobacter pylori associated human gastritis / P.J. Bergin, E. Anders, W. Sicheng, E. Johnsson, J. Andersson, H. Lonroth, P. Michetti, Q. Pan- Hammarstrom, M. Quiding-Jarbrink // Helicobacter. - 2004. – V. 9. – P. 201–210. 34. Burlaka A.P. Stomach Cancer: Interconnection between the Redox State, Activity of MMP-2, MMP-9 and Stage of Tumor Growth / A.P. Burlaka, I.I. Ganusevich, M.R. Gafurov, S.M. Lukin, E.P. Sidorik // Cancer Microenvironment. – 2016. - doi 10.1007/s12307-016-0182-5. 35. Bustin S.A. Absolute quantification ofmRNAusing real-time reverse transcriptionpolymerase chain reaction assays / S.A. Bustin // J. Mol. Endocrinol. – 2000. – V.25. – P.169-193. 36. Cho J. H. The IL-1B Genetic Polymorphism Is Associated with Aspirin-Induced Peptic Ulcers in a Korean Ethnic Group / J.H. Cho, J.S. Choi, S.W. Chun, S. Lee, K.J. Han, H.M. Kim // Gut and Liver, V. 10, No. 3, May 2016, P. 362 – 368. 37. Chu S.H. Role of NF-?B and AP-1 on Helicobater pylori-induced IL-8 expression in AGS cells / S.H. Chu, H. Kim, J.Y. Seo, J.M. Lim, N. Mukaida, K.H. Kim // Digestive diseases and sciences. 2003. V. 48. №. 2. P. 257-265. 38. Costa A.M. Helicobacter pylori activates matrix metalloproteinase-10 in gastric epithelial cells via EGFR and ERK-ediated pathways / A.M. Costa, R.M. Ferreira, I. Pinto-Ribeiro, I.S. Sougleri, M.J. Oliveira, L. Carretto, M.A Santos, D.N. Sqouras, F. Carneiro, M. Leito, C. Fiqueiredo // Journal of Infectious Diseases Advance Access. – 2016. – P.1 – 30. 39. de Waal Malefyt R. Interleukin 10 (IL-10) inhibits cytokine synthesis by human monocytes: an autoregulatory role of IL-10 produced by monocytes / R. de Wall Malefyt, J. Abrams, B. Bennett, C.G. Figdor, J.E. de Vries // J. Exp.Med. – 1991. –V. 174. – P. 1209–1220. 40. Dey S. Matrix metalloproteinase3 gene promoter polymorphisms and their haplotypes are associated with gastric cancer risk in Eastern Indian population / S. Dey, S. Stalin, A. Gupta, D. Saha, K. Kesh, S. Swarnakar // Molecular carcinogenesis. – 2011. – V. 51. – P. 1-12. 41. Freeman A. Peptic ulceration in identical twins / A. Freeman // British Medical J. - 1947. - P.765. 42. Gabay C. Interleukin-6 and chronic inflammation / C. Gabay // Arthritis Research and Therapy – 2006. – V.8. – P. 6. 43. Ganguly K. Hydrogen peroxide-mediated downregulation of matrix metalloprotease-2 in indomethacin-induced acute gastric ulceration is blocked by melatonin and other antioxidants. / K. Ganguly, P. Kundu, A. Banerjee, R.S. Reiter, S. Swarnakar // Free Radic Biol Med 2006; 41: 911-925 [PMID: 16934674 DOI: 10.1016/j.freeradbiomed.2006.04.022]. 44. Gatti L.L. Interleukin-6 polymorphism and Helicobacter pylori infection in Brazilian adult patients with chronic gastritis / L.L. Gatti, R.R. Burbano, M.T. Zambaldi-Tunes, R.W. de Labio, P.P. de Assumpcao, M. de Arruda Cardoso-Smith, S.L. Marques-Payao // Clinical and Experimental Medicine. – 2005. – V. 5. – P. 112 – 116. 45. Gerhard D.S. Human collagenase gene is localized to 11q / D.S. Gerhard, C. Jones, E.A. Bauer, A.Z. Eisen, G. Goldberg // Cytogenet. Cell Genet. – 1987. – V. 46. – P. 619. 46. Hofner P. Genetic Polymorphisms of NOD1 and IL-8, but not Polymorphisms of TLR4 Genes, Are Associated with Helicobacter pylori-Induced Duodenal Ulcer and Gastritis / P. Hofner, Z. Gyulai, Z. F. Kiss, A. Tiszai, L. Tizslavicz, G. Toth, D. Szoke, B. Molnar, J. Lonovicz, Z. Tulassay, Y. Mandy // Helicobacter. – 2007. – V.12. – P. 124 – 131. 47. Hwang I. R. Effect of interleukin 1 polymorphisms on gastric mucosal interleukin 1beta production in Helicobacter pylori infection / I. R. Hwang,, T. Kodama, S. Kikuchi, K. Sakai, L. E. Peterson, D. Y. Graham, Y. Yamaoka // Gastroenterology. – 2002. – V.1236. – P. 1793-1803. 48. Kamali-Sarvestani E. Association of H pylori cagA and vacA genotypes and IL-8 gene polymorphisms with clinical outcome of infection in Iranian patients with gastrointestinal diseases / E. Kamali-Sarvestani, A. Bazargani, M. Masoudian, A. Lankarani, A. R. Taqhavi, M. Saberiferoozi / World J Gastroenterol. – 2006. – V.12. – P. 5205–5210. 49. Kim H.U. Diagnostic and Treatment Approaches for Refractory Peptic Ulcers / H.U. Kim // Korean Society of Gastrointestinal Endoscopy. – 2015. -http://dx.doi.org/10.5946/ce.2015.48.4.285. - P. 285-290. 50. Kusters J.G. Pathogenesis of Helicobacter pylori infection / J.G. Kusters, A.H. van Vliet, E.J. Kuipers // Clin Microbiol Rev 2006; 19(3): 449-90. 51. Lee S-G., TNF/LTA polymorphisms and risk for gastric cancer/duodenal ulcer in the Korean population / S-G. Lee, B. Kimb, J-H.Yook et al // Cytokine. – 2004. - V. 28. – P. 78 – 82. 52. Matsunari O. Association between Helicobacter pylori virulence factors and gastroduodenal diseases in Okinawa, Japan / O. Matsunari, S. Shiota, R. Suzuki, M. Watada, N. Kinjo, K. Murakami, T. Fujioka, F. Kinjo, Y. Yamaoka // J Clin Microbiol. – 2012. – V. 50. - № 3. – P. 876-883. 53. Matsuo Y. Helicobacter pylori cagA 12-bp insertion can be a marker for duodenal ulcer in Okinawa, Japan / Y. Matsuo, S. Shiota, O. Matsunari, R. Suzuki, M. Watada, T.t T. Binh, N. Kinjo, F. Kinjo, Y. Yamaoka // J Gastroenterol Hepatol. – 2013. – V.28 - №2. – P. 291-296. 54. Mei Q. Associations of the IL-1 and TNF gene polymorphisms in the susceptibility to duodenal ulcer disease in Chinese Han population / Q. Mei, J. M. Xu, H. L. Cao et al. // International Journal of Immunogenetics. – 2009. – V. 37. – P. 9 – 12. 55. Nedwin G.E. Human lymphotoxin and tumor necrosis factor genes: structure, homology and chromosomal localization / G. E. Nedwin, S. L. Naylor, A. Y. Sakaguchi, D. Smith, J. Jarrett-Nedwin, D. Pennica, D. V. Goeddel, P. W. Grayet // Nucleic Acids Res – 1985 – V. 13. – P. 6361-6373. 56. Nelson D. R. Interleukin 10 treatment reduces fibrosis in patients with chronic hepatitis C: a pilot trial of interferon nonresponders / D. R. Nelson, G. Y. Lauwers, J. Y. Lau, G. L. Davis // Gastroenterology. – 2000. – V. 118. – P. 55. 57. Pena A. S. Genetic factors determining the host response to Helicobacter pylori / A. S. Pena // World J Gastroentero. - 2000. - V.6. - P. 624 -625. 58. Pimanov S. L. Helicobacter pylori eradication improves gastric histology and decreases serum gastrin, pepsinogen I andpepsinogen II levels in patients with duodenal ulcer / S. L. Pimanov, E. V. Makarenko, A. V. Voropaeva et al. // J Gastroenterol Hepatol. – 2008. – V.28. – P. 1666 – 1671. 59. Smith A. J. Cytokine and cytokine receptor gene polymorphisms and their functionality / A. J. Smith, S. E. Humphries // Cytokine Growth Factor. 2009. – 20: 43 – 59. doi: 10.1016/j.cytogfr.2008.11.006. 60. Song, Y-X. The association between individual SNPs or haplotypes of matrix metalloproteinase 1 and gastric cancer susceptibility? Progression and prognosis. / Y-X. Song, X. Zhou, Z-N. Wang, P. Gao, A-L. Li, J-W. Liang, J-L. Zhu, Y-Y. Xu, H-M. Xu // Plos one. – 2012.-http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0038002 61. Taggart, R. T. Assignment of human preprogastricsin (PGC) to chromosome 6 and regional localization of PGC (6pter-p21.1), prolactin PRL (6pter-p21.1) / R. T. Taggart, T. K. Mohandas, G. I. Bell // Cytogenet. Cell Genet – 2007. – V. 46. - P. 701-702. 62. Tomb J. F. The complete genome sequence of the gastric pathogen Helicobacter pylori / J. F. Tomb, O. White, A. R. Kerlavage, et al. // Nature – 1997. – V. 388 – P. 539-547. 63. Wang F. Prevalence and risk factors of asymptomatic peptic ulcer disease in Taiwan / F. Wang, M. Tu, G. Mar, H. Chuang, H. Yu, L. Cheng, P. Hsu // World J Gastroenterol. - 2011. - V.17. - Р. 1199-1203. 64. Wang S. Protective effects of Weilikang decoction on gastric ulcers and possible mechanisms / S. Wang, Y. Ni, J. Liu et al. //J.Nat Med. – 2016. - DOI 10.1007/s11418-016-0985-1 65. Woo M, Clinical implications of matrix metalloproteinase-1, -3, -7, -9, -12, and plasminogen activator inhibitor-1 gene polymorphisms in colorectal cancer / M. Woo, K. Park, J. Nam, J.C. Kim // Gastroenterol Hepatol. – 2007. – V.22. – P. 1064–1070. 66. Xu Q. Functional analysis of iceA1, a CATG-recognizing restriction endonuclease gene in Helicobacter pylori / Q. Xu, R.D. Morgan, R.J. Roberts et al // Nucleic acids Res – 2002. – V.30 - №17. – P. 3839-3847. 67. Xue H. A meta-analysis of interleukin-8 -251 promoter polymorphism associated with gastric cancer risk / H. Xue, J. Liu, B. Lin, Z. Wang, J. Sun, G. Huang // PLoS One. – 2012. – Vol.7. – P.280 – 283. 68. Yakoob, J. Comparison of the virulence markers of Helicobacter pylori and their associated diseases in patients from Pakistan and Afghanistan / J. Yakoob, Z. Abbas, W. Jafri et al. // Jaudi J Gastroenterol.- 2013. – V.19. – P. 211 – 218.

ГЛАВА 1. 1.1. Язвенная болезнь желудка – этиология и патогенез Язвенная болезнь желудка – хроническое заболевание желудочно-кишечного тракта, при котором под воздействием соляной кислоты и пепсина в желудке образуются язвы. Протекает заболевание в результате нарушения нервных и гуморальных процессов, для него характерны рецидивы[4]. Язвенной болезнью страдает огромное число людей. Например в Европе число язвенников составляет 2—3% населения [4]. В России распространенность данной патологии среди всего населения составляет около 12 % . Результаты патологоанатомических исследований дают более высокие цифры (28 %), что может свидетельствовать о латентном течении заболевания у многих больных [8,10]. По данным ФГУ «Минздравсоцразвития РФ» данной патологией в России страдают приблизительно 3 миллиона человек в 2019 году. Всего с диагнозом, установленном впервые в жизни, регистрируются больных: в Центральном Федеральном Округе – 89.5 на 100000 всего населения; Приволжском Федеральном Округе – 134 на 100000 всего населения (http://www.mednet.ru). По мнению некоторых авторов, язва двенадцатиперстной кишки (ЯДК) у пациентов моложе 15 лет встречается редко, а язва желудка встречается даже у пятилетних детей. Возможно, язвенная болезнь двенадцатиперстной кишки развивается только у тех пациентов, которые были инфицированы Helicobacter pylori в позднем детском или в зрелом возрасте, так как с этого времени количество обкладочных клеток не меняется [7]. Schubert же считает, что ЯБДПК обычно диагностируется в молодом возрасте, у мужчин, и у пациентов с высокой секрецией соляной кислоты, а ЯБЖ чаще встречается у пожилых, у пациентов с нормальной или пониженной кислотной секрецией [22].